Структурними підрозділами Кременецької районної комунальної лікарні є:

Адміністративна частина:

• управління лікарнею (головний лікар, його заступники, фінансово- економічний відділ та бухгалтерія, відділ кадрів);
• інформаційно-аналітичне відділення;

Лікувально-профілактична частина:

А – стаціонарний сектор:

• приймально-діагностичне відділення невідкладної медичної допомоги;
• терапевтичне відділення з кардіологічними ліжками;
• хірургічне відділення з травматологічними та урологічними ліжками;
• акушерсько-гінекологічне відділення;
• дитяче відділення;
• інфекційне відділення;
• відділення анестезіології та інтенсивної терапії;
• відділення інтервенційної кардіології реперфузійної терапії та рентгеноендовазкулярної хірургії;
• ендокринологічне відділення;
• неврологічне відділення;
• отоларингологічне відділення з офтальмологічними ліжками;
• гемодіалізне відділення;

Б – амбулаторний сектор:

• фізіотерапевтичне відділення;
• жіноча консультація;
• поліклінічне відділення;
• відділення трансфузіології;
• клініко-діагностична лабораторія;
• рентгенологічне відділення;
• діагностичне відділення;

Адміністративно-господарська частина:

• централізована автоклавна;
• дезінфекторська;
• харчоблок;
• інженерна служба;
• пральня;
• автомобільна служба;
• медична бібліотека;
• медичний архів.